Quelques mois après la bataille du Sanctuaire, une nouvelle menace s'était abattue sur la Terre. Poséidon, le Dieu des mers, réincarné dans le corps de Julian Solo, avait déclenché une pluie diluvienne sur toute la planète ( il estimait qu'elle était totalement corrompue et qu'il était temps de bâtir un nouveau monde ). Voulant sauver l'humanité, et rejetant toute alliance avec le dieu, Athéna s'était offerte en sacrifice. Enfermée dans le Pilier central du Sanctuaire sous-marin, elle avait accepté de recevoir toute l'eau du déluge. En remplissant petit à petit l'intérieur du gigantesque pilier, toute cette eau devait inéluctablement la noyer.
C'est pourquoi Seiya et ses compagnons se sont rendus à leur tour au royaume de Poséidon ( sous la Méditerranée ). Ayant appris par la Sirène Thétis que le Pilier Central était absolument indestructible à moins de détruire auparavant les piliers des sept mers, les chevaliers de bronze se séparent et combattirent les sept généraux des mers, protégeant chacun l'une des colonnes. Au bout d'une bataille acharnée, ils réussirent à détruire les piliers après avoir vaincu leurs gardiens.
L'affrontement final avec Poséidon fut d'une violence inouïe, et c'est finalement au prix de nombreux sacrifices que Seiya réussit à libérer Athéna, en détruisant le Pilier central. Celle-ci parvint alors, avec l'aide de ses chevaliers, à capturer à nouveau l'esprit de Poséidon dans l'urne sacrée qui repose dorénavant au fond de la Méditerranée, parmi les ruines du temple.
On avait appris au cours de la bataille que le dieu des mers avait en fait été manipulé par l'ambitieux Canon, le frère jumeau de Saga ( le chevalier d'or des Gémeaux ), qui comptait bien s'emparer de la planète et se venger d'Athéna par la même occasion. Pris de remords, Canon s'était finalement interposé entre Poséidon et Athéna et avait reçu, à la place de celle-ci, les lames du trident de l'Empereur des mers ( version du manga ). Il avait donc été laissé pour mort à la fin de l'histoire...
On s'était demandé pourquoi les cinq chevaliers d'or survivants étaient restés cloîtrés au Sanctuaire d'Athéna, le Vieux Maître leur ayant interdit d'intervenir dans la bataille, alors que ce sont finalement les esprits d'Aioros, Camus et Shura, les chevaliers d'or défunts, qui ont du venir en aide aux chevaliers de bronze. On comprendra enfin pourquoi lors de la deuxième bataille du Sanctuaire...
La musique que vous entendez ( si vous avez une bonne carte son ) est "Under Sea Temple" ( "LeTemple Sous-Marin" ) au format "midi". Elle a été jouée à fin de la bataille contre Poséidon. Après l'écroulement du Sanctuaire sous-marin, Seiya et ses compagnons sont sauvés de la noyade par la cosmo-énergie d'Athéna qui forme une bulle de protection autour d'eux et leur permet de revenir à la surface. Le soleil refait son apparition au milieu des nuages et, dans le ciel du Sanctuaire, les visages d'Aioros, de Saga, de Camus et de Shura apparaissent aux chevaliers d'or survivants...